Le microbiome du lait maternel évolue au cours du temps.
Le colostrum contient principalement les genres Weisella, Leuconostoc, Staphylococcus, Streptococcus et Lactococcus.
Après 1 à 6 mois apparaissent d’autres micro-organismes des genres Veillonella, Leptotrichia et Prevotella, des bactéries typiques de la cavité buccale.